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在转录组水平上研究半滑舌鳎在感染鳗弧菌前后的免疫响应将有助于更深刻的理解鱼类的分子免疫机制，同时也为抗病品种培育提供参考。本文应用Illumina的RNA-Seq技术对感染前后半滑舌鳎免疫相关组织进行了高通量测序，除去接头、低质量序列之后，采用拼接软件Trinity对所得序列进行de-nov组装，初步的表达差异基因分析显示，部分免疫相关基因出现了表达量差异。通过对感染鳗弧菌前后半滑舌鳎免疫相关组织转录组的从头组装与功能注释，获得了大量相关的转录本信息，可以用于进一步用于表达谱与比较转录组分析。