基于多个晶体结构的淋巴酪氨酸特异性磷酸酶抑制剂虚拟筛选

• 作 者: 侯旭奔[1]李康帅[2]孙金鹏[2]方浩[1]
• 机 构: 山东大学药学院,天然产物化学生物学教育部重点实验室,山东 济南 250012
• 出 处: 第一届《药学学报》药学前沿论坛暨2015年中国药学会中药与天然药物专业委员会会议
• 发表日期: 2015年期

　　在计算机辅助药物设计研究中，大分子蛋白质结构的柔性是高通量虚拟筛选所面临的重要问题。近年来，随着结构生物学的飞速发展，越来越多的蛋白晶体结构被解析报道，因此，基于多个蛋白结构的整体对接(ensemble docking)技术可有效的处理蛋白柔性问题。本研究针对自身免疫性疾病治疗领域的新型靶标——淋巴酪氨酸特异性磷酸酶(LYP)的多个晶体结构，发展了一个基于对接的虚拟筛选模型。方法学研究表明，与单一晶体结构相比，利用多个晶体结构的虚拟筛选能有效的提高成功率。作者成功地应用该方法发现了8个新型小分子LYP 抑制剂，其中活性最好的化合物B15 在对其他的蛋白磷酸酶具有一定的选择性，并且能够有效影响JruKat T细胞中的TCR 信号通路。