【摘 要】
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真骨鱼类是指辐鳍鱼类中除去软骨硬鳞鱼类(多鳍鱼,鲟鱼)和全骨鱼类(雀鳝,弓鳍鱼)以外的其他鱼类,它包括绝大多数现生鱼类。真骨鱼类是最为繁盛的脊椎动物类群,据《世界鱼
【机 构】
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中国科学院水生生物研究所,武汉,430072
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真骨鱼类是指辐鳍鱼类中除去软骨硬鳞鱼类(多鳍鱼,鲟鱼)和全骨鱼类(雀鳝,弓鳍鱼)以外的其他鱼类,它包括绝大多数现生鱼类。真骨鱼类是最为繁盛的脊椎动物类群,据《世界鱼类》的记载,现生的真骨鱼类大约有26840 种,是全部鱼类数目的96％,接近所有脊椎动物总量的一半。是什么原因导致了真骨鱼类如此大量的适应性辐射？其适应性进化的基因组学基础是什么？为了探讨上述问题,我们利用比较基因组学及生物信息学的方法,从真骨鱼类谱系特异基因的角度对真骨鱼类适应性进化的机制进行了系统性的分析。我们首先利用BLAST比对软件鉴定得到了两组基因：真骨鱼类谱系特异基因(135个)和斑马鱼物种特异基因(66个)。和进化上保守的基因相比,谱系特异基因有如下特征：序列长度短,外显子数目少,GC含量高,并且表达数目少。另外谱系特异基因在斑马鱼的基因组上染色体分布是不均匀的。起源分析显示基因复制产生了大部分的谱系特异基因。时空表达谱分析表明：1)谱系特异基因更倾向于在大脑及性腺中表达；2)更倾向于在胚胎发育晚期及幼鱼早期阶段高表达。功能聚类分析的结果表明,真骨鱼类谱系特异基因显著富集于跟免疫反应相关的功能中。该研究为进一步揭示真骨鱼类的适应性辐射进化的分子机制提供了重要的参考价值。
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