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在色谱图基线校正和峰匹配的基础上，提出以银杏叶HPLC指纹图谱的色谱图轮廓作为输入，抗氧化活性作为输出，建立最小二乘支持向量机回归模型，用于银杏叶提取物总抗氧化活性的预测。与目前普遍使用的误差反向传播神经网络和偏最小二乘回归的预测结果比较，最小二乘支持向量机建模方法更为准确；与采用色谱峰面积为分析变量的模型预测结果比较表明：采用消除干扰后的全谱轮廓保留了样本的全部信息，预测结果更好，实现了数据分析的客观准确。