基于转录组测序的沟叶结缕草(Zoysia. metrella)应答低温胁迫研究

来源 :2015全国植物生物学大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hy1208
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  结缕草属植物(Zoysiaspp.)是一类优质的暖季型草坪草,建植的草坪具有质地优美、耐高温、耐旱、耐践踏、抗杂草等多种优点,在全球热带、亚热带区域广泛种植.但结缕草不耐低温,在长江流域绿期仅180~210 天.提高抗寒性以延长青绿期成为结缕草研究的重要内容之一,在分子水平上研究结缕草对低温胁迫响应特征将有利于指导其抗寒育种和草坪管理.基于Illumine 测序平台,本研究对广泛种植的沟叶结缕草(Z.metrella)的叶片进行了转录组测序,研究了常温(CK)、4℃低温处理2h(CT_2)和72h(CT_72)后的基因表达特点.共获得了183,097,850 条高质量clean reads,Trinity 软件拼接获得了47,267 条非冗余转录本(unigenes),平均长度986 Nt,N50 为1521Nt.基因差异表达分析显示,与CK 相比,CT_2 中有796 个差异表达基因(482 个上调,341 个下调),CT-72中有6735 个差异表达基因(3991 个上调,2744 个下调).分别对差异表达基因进行GO 和KEGG 分析结果表明,CT_2 中主要与呼吸作用电子传递和氧化磷酸化、光合作用电子传递、苯丙素生物合成、氧胁迫响应等相关;CT_72 中主要与光合作用的光反应和暗反应、硝酸盐跨膜运输和氮同化、淀粉和糖代谢、卟啉与叶绿素代谢、激素水平调节等相关.与抗寒性相对较强的日本结缕草(Z.japonicaSteud.)比较分析显示,两物种的转录组序列相似度>85%,但是低温胁迫下二者在呼吸与氧化磷酸化、光合系统与光合作用、氮同化、细胞分裂素代谢、水分运输、抗氧化胁迫等过程的相关基因的表达模式具有显著差异.这些差异与两物种抗寒能力的不同是否有关有待深入研究.
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