【摘 要】
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采用T-RFLP、RT-qPCR和克隆测序等分子生物学技术,以氨单加氧酶基因(ammonia monooxygenase,amoA)为分子标记,研究了北运河表层沉积物中氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB
【机 构】
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首都师范大学资源环境与旅游学院,北京 100048
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采用T-RFLP、RT-qPCR和克隆测序等分子生物学技术,以氨单加氧酶基因(ammonia monooxygenase,amoA)为分子标记,研究了北运河表层沉积物中氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)的群落多样性、丰度、系统发育及其与环境因子的响应关系.结果表明,沉积物中AOB的群落多样性和丰度均高于AOA,是北运河沉积物中氨氧化过程的主要功能微生物.沉积物中氨氧化微生物群落结构沿干流和支流存在明显的空间分异,而AOA的种类组成空间差异较小；沉积物的氨氮(NH4+)和硝态氮(NO3﹣+NO2﹣)是影响氨氧化微生物群落特征的主要因子,AOB对环境变化的敏感性更高；AOA和AOB的amoA基因拷贝数分别为1.32×105～1.91×106 copies/g、5.39×105～8.3×106 copies/g,总amoA基因的丰度由细菌的amoA拷贝数决定,闸坝下游沉积物的氨氧化微生物丰度最高.系统发育分析表明amoA基因序列多属于土壤/沉积物分支,AOB的克隆序列与土壤亚硝化螺菌属(Nitrosospira)的类群相似性可达98％.受污水处理厂退水的影响,部分amoA基因序列与污水处理厂废水和活性污泥中发现的类群同源性高.污染物质来源、支流汇入和闸坝拦截对河流沉积物氨氧化微生物的群落特征影响显著.
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