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近年来，猪流行性腹泻在我国不断发生爆发，且流行的季节性越来越不明显。为了解河南省PEDV基因变异情况，本文对分离于河南省不同地区11株PEDV野毒株M基因和ORF3基因进行分析。结果显示，PEDV可分为3个群，11株河南分离株均属第3群，与近年韩国地方分离株亲缘关系较近，而与欧洲株、中国现用疫苗株及往年中国地方分离株亲缘关系较远。提示可能需要研发新的疫苗株来有效预防该病发生。