H1N1亚型猪流感病毒中国分离株核蛋白基因分子演化的研究

来源 :第六次人畜共患病学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Tianzh
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本研究对2001年中国华南及东北地区的15株H1N1亚型猪流感病毒(SIV)分离株的核蛋白(NP)基因进行了序列测定和分析,并绘制了进化树.研究结果表明,15株H1N1亚型SIV的NP基因核甘酸全长为1565bp,共编码498个氨基酸.经同源性比较结果中知,除SW/HLJ/395/01外,其余14株H1N1亚型SIV的NP基因核苷酸序列与参考毒株SW/BJ/94/91保持相对最高的同源性,核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为96.5~97.4﹪、97.8~99.0﹪;并且与类猪人流感病毒WIS/3523/88和NJ/8/76核苷酸序列的同源性也可分别达到95.5~96.5﹪、92.7~93.7﹪,推导氨基酸序列的同源性分别为96.8~99.0﹪、94.6~97.2﹪,相对较高.但是,SW/HLJ/395/01与类禽型H1N1猪谱系的代表毒株SW/GER/2/81同源性最高,核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为93.9﹪和99.0﹪.经进化树分析可见,SW/HLJ/395/01属于类禽H1N1猪谱系,其它14株H1N1亚型SIV的NP基因皆属于古典型H1N1猪谱系.
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