【摘 要】
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(目的)为系统了解绵羊瘁螨(Psoroptes ovis)的转录组特征,为痒螨致病机理与功能基因的研究奠定基础。(方法)本研究采用第二代测序技术(Illumina)和高效的Trinity组装软件
【机 构】
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四川农业大学动物医学院动物寄生虫病研究中心,成都 611130
【出 处】
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中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会第十三次学术研讨会
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(目的)为系统了解绵羊瘁螨(Psoroptes ovis)的转录组特征,为痒螨致病机理与功能基因的研究奠定基础。(方法)本研究采用第二代测序技术(Illumina)和高效的Trinity组装软件以及生物信息学分析方法,对绵羊瘁螨(兔亚种)的幼螨、若螨与成螨不同发育时期进行转录组的测序与分析。(结果)经过测序获得的reads组装成了38836个unigenes,平均长度825 bp；基于7个数据库(NR,NT,KO,Swiss-Prot,PFAM,GO和KOG)进行比对,共有17366个unigenes被注释。通过对不同发育时期转录组数据的差异表达分析,共筛选到1316个差异表达基因,以幼螨与若螨和成螨比较,在幼螨阶段有496个unigene上调,820个unigene下调。(结论)本研究获得的转录组数据为深入研究痒螨的致病机理、疫苗抗原和药物靶标的筛选等奠定了基础。
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