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本实验以湖南省蔬菜研究所选育的辣椒胞质雄性不育系9704A、保持系9704B和恢复系9701为试验材料，比较“三系”mtDNA的ISSR多态性，为揭示胞质雄性不育性与mtDNA之间的关系积累资料。实验利用POPGENE软件对辣椒“三系”线粒体DNA的ISSR标记进行分析，结果表明，辣椒不育系与保持系之间的遗传关系较近，与恢复系之间的遗传距离较远。