【摘 要】
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目的 利用生物信息学技术分析过敏原Jun v.1的B表位和T表位.方法 利用Bioinformatics Predicted Antigenic Peptides (BPAP) system和BepiPred 1.0 server两个软件预测B表位;利用SYFPEITHI和NetMHCII-2.2两个软件预测T表位.结果 通过BPAP预测出的B表位是4-22, 41-49, 101-109, 12
【机 构】
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江苏省人民医院,药学部 210029
【出 处】
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中华医学会2015年全国变态反应学术会议
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目的 利用生物信息学技术分析过敏原Jun v.1的B表位和T表位.方法 利用Bioinformatics Predicted Antigenic Peptides (BPAP) system和BepiPred 1.0 server两个软件预测B表位;利用SYFPEITHI和NetMHCII-2.2两个软件预测T表位.结果 通过BPAP预测出的B表位是4-22, 41-49, 101-109, 124-168, 188-201,213-224, 234-240,254-262,302-314, 325-333;通过BepiPred 1.0 server预测出的B表位是22-37, 51-85, 111-124,166-174, 189-191,225-234, 243-253, 263-269, 274-299, 305-311,321-325, 335-362.最后,对这两个软件预测出的B表位进行综合,结果是22-30, 51-85, 112-124, 166-174, 188-191, 225-234,243-250, 263-269275-290, 305-312, 321-325 and 336-360. 通过SYFPEITHI预测该过敏原的T表位是7-21, 86-100, 163-177, 339-343, 10-24, 133-147, 269-283, 293-307,195-209, 297-311,345-359, 107-121, 128-142, 240-154, 312-326;通过NetMHCII-2.2预测该过敏原的T表位是10-18, 81-89, 89-97, 91-99, 93-101, 98-106, 130-138, 136-144,198-206, 240-248, 243-251,271-279,342-350;最后,对这两个软件预测出的T表位进行综合,结果是81-101,130-138, 136-144, 198-206,240-248 and 342-350.
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