Accurate Force Field Development for Modelling Macromolecular Assemblies Containing Diketopyrrolopyr

来源 :2019中国化学会第十五届全国计算(机)化学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yehyuan
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  It is challenging to find sufficiently accurate force fields for applications where equilibrium structures generated from classical molecular dynamics simulations are employed in post quantum chemistry calculations.1 One particular application is in the study of optical and electronic properties of materials and biomolecules.
其他文献
毛细管电泳非接触式电导检测器以其在无机离子和某些有机离子检测方面具有较大优势[1],应用日趋广泛[2]。在其发展过程中,有许多关于非接触电导检测电路优化改进的报道[3],但不同课题组得到的结果存在较大差异。
准确的质量测定在识别未知化合物方面有着重要的作用,通过对分子量的精确测定可以确定化合物的元素组成并推断其分子结构,因而广泛用于药物小分子的表征、蛋白质的识别及生物大分子的鉴定,因此如何实现分子量(质荷比)的精确测定是一个有科学价值的问题。
在以往的细菌质谱()定过程中,必()要足够()(>104 cells/样品点)的细菌才能够产生较好的质谱信号用于()定。作者受到单细胞代谢物检测和微()列()板的启发,即在样品点尺寸和激光光斑大小接近时,即使细菌个数极低(20~40cells)也能产生相对较好的质谱信号以用于细菌()定。
我们设计并合成了一种新的基于"AND"逻辑门控的荧光探针,1-(3,6-双((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)-3-氧代螺(异吲哚啉-1,9-黄嘌呤))-2-基)-3-苯基硫脲(FPSi),用于快速同时检测F-和Hg2+(DMSO/H2O = 7∶3,v/v)。
溶血性大肠杆菌E.coli O157:H17 作为溶血性肠炎的主要致病菌,具有爆发流行、致病性强、致死率高等特点[1].目前关于E.coli O157:H17 的检测方法主要存在耗时长,成本高、灵敏度低等问题,发展更加快速、稳定、灵敏、高效且低成本的检测方法对于溶血性肠炎的有效控制至关重要[2].
随着工业的发展,越来越多的重金属污染物被排放到自然环境当中,由于其不可降解,且容易通过食物链在人体内积累,对环境和人体健康都造成了极大的威胁[1]。
重金属污染物在环境污染物中占很大比重,严重危害人体健康,而用简便的吸附过程富集去除重金属污染物是一种行之有效的重要手段。在环境修复材料中,二维过渡金属硫化物具有良好的片层结构可以充分暴露吸附位点,此类材料往往可以对重金属离子产生稳定高效的化学吸附。
众所周知,农药在保护农作物茁壮生长,抵抗植物病、虫害破坏等方面起到重要作用。但是农药的过度使用问题也越来越引起人们的关注,喷洒在农田中的农药渗入水体系后通过食物链生物富集在人体中,从而导致小脑失调、造血器官障碍等疾病[1]。因此对多种类农药的浓度进行监测是十分必要的。碳纳米纤维因具有比表面积大、结构致密等优点已广泛应用于微萃取当中。
Macrodomains constitute a protein motif family present in all kingdoms of life1.Emerging evidence indicates that specific macrodomain proteins interact with mono-ADP-ribosylation(MARylation) on target
Through coarse-grained molecular dynamics simulation,we aim to uncover the rupture mechanism of the nanofiller filled polymer nanocomposites by characterizing the structural and dynamic changes during