【摘 要】
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本研究利用全基因组数据,分析了地中海涡虫、日本血吸虫、微小膜壳绦虫、细粒棘球蚴和多房棘球蚴等扁形动物的miRNAs及其在基因组上的分布.结果发现,miR-71/2、miR-1/133和mi
【机 构】
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中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室甘肃省动物寄生虫病重点实验室 甘肃兰州730046
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第七次代表大会暨第十二次学术研讨会
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本研究利用全基因组数据,分析了地中海涡虫、日本血吸虫、微小膜壳绦虫、细粒棘球蚴和多房棘球蚴等扁形动物的miRNAs及其在基因组上的分布.结果发现,miR-71/2、miR-1/133和miR-277/4989以簇的形式排布,特别是miR-71/2簇,在五种生物中非常保守,并且在S.mediterranea大量扩增,有5个基因座.以已知蛋白基因的位置为标志,比较分析miRNAs在基因组中的相对位置和转录方向,结果表明大部分miRNAs在扁形动物中的分布非常保守;同时也发现,有一部分miRNAs(~41%)的相对位置和转录方向发生了变化.如miR-2a在棘球绦虫中与含伴侣素TCP1基因同向转录,而在微小膜壳绦虫中与含伴侣素TCP1基因转录方向相反.与棘球蚴绦虫标记,这些miRNAs相对位置和转录方向的变化主要发生在微小膜壳绦虫、日本血吸虫或/和地中海涡虫.以上结果揭示,在这些miRNAs基因座周围存在染色体重排的现象.
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