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:水稻单株穗数直接影响水稻单位面积的产量,对单株穗数相关数量性状位点的鉴定和挖掘对水稻产量育种具有十分重要的理论意义和实际价值.本研究利用日本晴为供体亲本,广陆矮4 号为轮回亲本构建的染色体片段代换系及其衍生群体精细定位一个控制水稻单株有效穗数主效QTL qPN1.2007 年在海南种植亲本和代换系群体,其中株系C3074 与轮回亲本相比,表现每株穗数减少,株高变矮,穗长变短.经分子检测,该株系含有来源于日本晴的大约2.6Mb 的导入片段.在播种后30 天到抽穗共80 天的时间内,该单片段代换系单株有效穗数均显著少于对照亲本;在多株栽插(每穴3 株)下,该单片段代换系和轮回亲本单株有效穗数的差异显著小于单株栽插;在两个环境条件下(扬州和海南),该单片段代换系和轮回亲本杂交衍生的F2 分离群体中,单株有效穗数均表现为一对1 对基因的遗传模式,命名为qPN1(Panicle numer 1),且多穗对少穗为显性;另外,该基因还表现有明显的多效性,其株高也显著低于轮回亲本,对株高进行遗传分析表明该性状也受一对隐性基因控制.来源于日本晴等位基因qpn1具有使分蘖减少、株高降低的遗传效应.利用衍生的F2、F3 分离群体中的1,429 个隐性单株对qPN1 进行了精细定位,成功将qPN1 水稻定位在第一染色体BAC 克隆AP003272 上分子标记S1-86 和S1-109 之间,物理距离约为34.4kb;通过生物信息学分析,该区段包括6 个开放阅读框(LOC_Os01g70520,LOC_Os01g70525,LOC_Os01g70540,LOC_Os01g70550,LOC_Os01g70560 和LOC_Os01g70570).该研究为qPN1 的克隆和功能基因组学研究奠定了基础,同时也为利用分子生物学技术改良水稻株型,培育水稻超高产品种奠定基础.