【摘 要】
：
目的 鉴定一缺指(趾)畸形家系(split-hand/split-foot malformation,SHFM)的致病基因,并对突变进行初步的功能分析.方法 在山东采集了—SHFM家系,对家系患者进行详细的临床和影像学检查,明确诊断为非综合征型SHFM.首先对已经报道的候选基因TP63进行突变检测,然后对家系先证者进行外显子组测序,测序结果利用dbSNP131,千人基因组计划数据库,HapMap数
【机 构】
：
山东大学实验畸形学教育部重点实验室,医学院医学遗传学研究所,济南 250012 山东省临沂市人民医
论文部分内容阅读
目的 鉴定一缺指(趾)畸形家系(split-hand/split-foot malformation,SHFM)的致病基因,并对突变进行初步的功能分析.方法 在山东采集了—SHFM家系,对家系患者进行详细的临床和影像学检查,明确诊断为非综合征型SHFM.首先对已经报道的候选基因TP63进行突变检测,然后对家系先证者进行外显子组测序,测序结果利用dbSNP131,千人基因组计划数据库,HapMap数据库过滤后,结合已定位遗传位点内的候选基因,对可疑变异进行筛查鉴定,利用正常对照人群中进行验证,同时利用生物信息学方法对突变进行功能预测,最后,构建人类DLX5基因野生型、突变型表达载体和MYC基因启动子荧光素酶表达载体,通过细胞转染和荧光素酶表达活性检测,验证突变基因对MYC基因转录激活作用.结果 利用外显子组测序,在DLX5基因第3外显子发现一错义突变(c.558 G＞T,p.Q186H).序列比对发现该氨基酸在多个物种中高度保守,利用SIFT及PolyPhen-2软件预测的结果表明,该突变对蛋白功能具有不利影响,然后,通过直接测序,对家系其他患者及正常成员进行突变位点分析,发现该突变与疾病表型共分离；随后在200名当地健康人群中进行验证,也未发现该突变,说明该位点不是罕见多态,而是SHFM1致病突变,利用荧光素酶报告基因技术发现DLX5突变基因转录激活MYC基因的表达显著下降,进一步证实该突变的致病性.结论本研究首次在中国人群中发现DLX5基因突变导致SHFM的发生,为进一步研究疾病的发生机制奠定基础.
其他文献
Objective: To determine the diagnostic accuracy, the validity, the current limitations and possible solutions of fetal RhD genotyping from maternal blood based on the existing English-written studies.
目的：通过对3002例有不良生育史；原发继发不孕症经妇科、生殖中心、遗传咨询门诊女性患者进行染色体核型分析,探讨染色体全自动扫描仪在Turner综合征低比例嵌合体核型检出率.方法：取患者外周血进行淋巴细胞培养,常规染色体G显带技术,结合自动扫描平台,设定扫描2张片80个中期分裂相,分析计数20～30个中期分裂相,分析5个核型,有异常者分析计数100个核型.结果：3002例患者通过扫描系统分析检出T
Objective: To compare the subsequent reproductive outcomes in couples with a history of recurrent pregnancy loss (RPL) associated with and without chromosome abnormalities.Methods: A retrospective coh
2013年将迎来国际"人类基因组计划(HGP)"正式完成十周年.HGP催生了一门新的学科——基因组学.基因组学的发展将进一步揭示人类基因组的进化特别是那些与适应性相关的基因的进化;揭示人类基因组的变异特别是那些与疾病相关的变异;揭示人体肠道微生物与疾病的关系.
Objective: To investigate the frequencies of AZF microdeletions in 137 infertile males with azoospermia and severe oligozoospermia from Jilin province of China and analyze the relationship between the
Objective: To determine the frequencies and the characteristics of Y chromosome microdeletion in infertile males from northeastern china in order to perform appropriate therapeutic choices.Methods: A
Objective: To report our successful experience on sperm retrieval in ejaculate of nonmosaic Klinefelters syndrome (KS) patients with semen cytology examination.To describe clinical parameters of KS pa
目的 探讨线粒体DNA (mtDNA)调控区、编码区的大片段缺失和APEX基因与HD的关系。方法 采用PCR-DNA测序法检测3个HD家系中10名患者和26名正常人的D环高突变区、编码区进行检测,采用PCR-SSCP的方法检测检测家系成员的APEX基因的外显子。结果 3家系成员mtDNAD环未见大片段缺失,6名患者和16名正常人都存在mtDNA编码区大片段缺失,未发现APEX的3个外显子上存在点突
目的 检测河南汉族人群蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型22 (PTPN22)基因rs33996649位点和rs2488457位点的多态性与肺结核的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测河南汉族205例正常人和214肺结核患者PTPN22的多态性,并进行基因型频率、等位基因频率的比较.结果 河南汉族群体中未发现rs33996649位点多态性；肺结核患者组和对照组rs2488457位点等
α地中海贫血/智力低下综合征(ATR-X,OMIM：301040)是一种罕见的X连锁的智力低下综合征.其主要的临床特征包括：智力和生长发育障碍,具有特殊的颜面畸形,通常伴有(或无)α地中海贫血,此外,其他的一些先天发育不良如骨骼肌肉发育异常,心脏缺陷,胃肠道症状,生殖器异常等也是此综合征的伴随症状.研究采集到了一个ATR-X综合征家系,患病的两兄弟均有该综合征特有的临床表型.运用外显子测序技术检测