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利用ISSR分析获得的数据,研究了5种抽样方法构建菠萝蜜核心种质的效果。并最终采用逐步聚类的方法从76份菠萝蜜种质中筛选出了19份核心种质,其保留了初始种质25.00%的样品,基因位点数、多态性位点数、多态性位点百分率、观测位点数、有效等位基因数、Neis遗传多样性指数和ShaJlnon;s信息指数的保留率分别为94.76%、90.40%、95.40%、97.83%、105.46%、118.07%、114.84%,核心种质能很好的代表初始种质。