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原子力显微镜(AFM)由于具有原子级的成像分辨率、皮牛级的测力灵敏度以及可以在生理条件下工作等优点，使其广泛应用于生物学领域.基于AFM 的单分子力谱技术(SMFS)可以提供关于配体-受体相互作用，弹性和刚度，以及蛋白质折叠和去折叠机制的信息.AFM 技术的另一个应用是分子识别成像，通过同时生成形貌图和识别图像不仅能反映出样品的形貌特征，而且能反应出两个分子之间的特异性相互作用和相应功能在样品表面的分布状态.