15种鹤COI条码比对及其系统发育分析

来源 :第十二届全国鸟类学术研讨会暨第十届海峡两岸鸟类学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:doer
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将15种鹤类的COI,cytb和12S rRNA序列及三者综合数据分别利用NJ法、ME法及ML法,采用K-2和MCL模型,以东方白鹤为外群,进行系统发育树分析。结果显示,不同方法得到的系统树,除置信度不同外,拓扑结构基本一致(ML法的K-2模型建树效果不理想),但不同序列之间的结果有所不同。其中COI的系统树拓扑结构与三者综合数据得到的基本一致:其结果均显示,黑冠鹤和灰冠鹤最先分化出来,然后是白鹤。之后又分成两大支,一支(A组)都属于鹤属,包括丹顶鹤、美洲鹤、灰鹤、白头鹤和黑颈鹤,依次分化,其中黑颈鹤与白头鹤的关系较近;另一支(B组)分为两小枝,B1支包括;白枕鹤、澳洲鹤和赤颈鹤,依次分化;B2支包括沙丘鹤、肉垂鹤、蓑羽鹤、蓝鹤,依次分化,其中沙丘鹤的位置置信度较低。但COI的在ML法的K-2模型中沙丘鹤的位置显示较B支先分化出来,其位置置信度低。可见,利用COI序列分析鸟类系统发育比较准确。
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