弓形虫MAPK1基因编码蛋白结构与功能的生物信息学分析

来源 :中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会第十三次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:LJ619
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  目的 分析并预测弓形虫丝裂原活化蛋白激酶1(TgMAPK1)基因编码蛋白的结构与功能,探讨其作为疫苗候选抗原及潜在药物靶点的可能性.方法 从Genebank数据库获取TgMAPK1基因序列,采用在线蛋白分析专家系统(http://ca.expasy.org/),结合DNAMAN、DNASTAR等生物信息学软件对该序列的编码区进行分析,预测该基因编码蛋白质的理化性质、翻译后修饰位点、功能域、亚细胞定位、二级结构、亲/疏水性、抗原表位等.结果 该基因全长1 772 bp,编码区为133~1 731bp,编码532个氨基酸.编码蛋白性质稳定,理论分子质量单位为58.376 kDa.TgMAPK1蛋白有5个跨膜区,有3个N端糖基化位点、7个蛋白激酶C磷酸化位点、8个酪氨酸激酶磷酸化位点、2个环腺苷酸蛋白激酶磷酸化位点、10个N端肉豆蔻酰化位点及1个酰胺化位点;无信号肽,二级结构以无规卷曲为主;TgMAPK1基因主要存在于弓形虫虫体外膜上,有20个潜在的抗原表位.结论 弓形虫TgMAPK1基因编码蛋白为可溶性蛋白,有多个抗原表位,具有免疫原性,可作为弓形虫病疫苗候选抗原.
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