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以黑琴鸡基因组DNA为模板，采用L25(54)正交试验设计，对SSR反应体系中的4种关键因素(TaqDNA聚合酶、dNTPs、引物、DNA模板)进行优化。结果表明，各因素水平变化对 PCR反应影响的显著性依次为引物> Taq酶> dNTPs >DNA模板。建立黑琴鸡SSR-PCR最佳反应体系为：TaqDNA聚合酶 lU、dNTPs1.6mmoI/L、引物1.8umol/L、DNA模板40ng、10xbuffer2μl，总体积为20μl。