十字花科植物HSP22基因同源序列的克隆与进化分析

• 作 者: 程影[1]黄锐芝[2]钟新民[3]吴学龙[2]王五宏[3]刘智宏[2]李必元[3]
• 机 构: 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京 210095 浙江省农业科学院蔬菜研究所,杭州 310021
• 出 处: 中国园艺学会2011年学术年会
• 发表日期: 2011年期

　　采用PCR克隆技术，根据已报道的拟南芥的AtHSP22.0基因全长及其它物种同源序列设计特异引物，在十字花科植物大白菜、青菜、甘蓝型油菜CY、花椰菜、荠菜、芥菜、萝卜、芥菜型油菜川黄中克隆得到耐热相关基因AtHSP22.0的同源序列。测序得到的各物种的HSP22基因核苷酸序列，同GenBank中搜索获得拟南芥序列和亲缘关系较远的单子叶植物玉米的HSP22基因序列进行多序列联配。对得到的比对结果用MEGA4.0软件构建NJ系统树。相应氨基酸结构域及特性用ExPasy在线分析。二级结构用Bioinformatics & Biological computing在线分析。三维模型通过SWISS-MODEL完成。用MOLMOL对蛋白质的三级结构中多肽段定位，并绘制三级结构图。