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农业主体功能区划建设的核心在于强化农业发展的空间管治.依据主体功能区理论对中原经济区划分的五大农业区,现代农业发展水平趋异.郑州都市农业区的技术装备程度、中原城市群外围农业区的机械化和化学化以及黄淮海农业特区的水利化都居于较高水平,而西南部养护与防护区的农业投入水平总体偏低.针对各功能区分类指导、突出重点、梯次推进是中原经济区现代农业协调发展的关键.按照主体功能区的原理、规律与方法，促进中原经济区现代农业发展，符合现代农业区域发展、地区分工、突出优势、协调发展的经济社会规律。中原经济区需要协调好国家层面与省级层面战略定位的关系。不同主体功能区应采用不同机制推动现代农业发展。现代农业建设要遵循突出重点、梯次推进、协调发展的原则。中原区处于区域发展中心与核心农区的过渡地带，亟须探索“以工促农、以城带乡”的现代农业模式，引导科技与服务从中心向外围辐射。黄淮海区在提升粮食产能与保障粮食安全上潜能大，需要予以政策倾斜，发挥主体承载区的作用。西南部农业区应聚焦到特色农业与生态功能保障上，通过拓展农业多功能价值空间来促进现代农业的可持续发展。