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从医院信息化评价的发展历程来看，可以分为三个阶段：功能评价阶段、性能评价阶段、应用效果评价阶段。应用评价可以较好地平衡供应商功能提供与医院使用者之间的矛盾，更深入评估信息系统在医院内的应用情况，及时有效地进行反馈，更易受到管理者重视，是未来系统评价的主要发展方向。医院信息化成本效益评价仍是医院信息化应用评价中的难点，数据所有权及信息化协同收益并不完全归属医院是重要的影响原因。医院管理者在进行大规模信息技术投资前，无论是在事前还是事后，必须学习逐步建立适合的模型，进行测量和评估，逐步修正，才能更好地促进信息技术项目达到建设目标。