【摘 要】
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根据Genbank已发表的ERF基因序列设计特异性引物,采用PCR和RT-PCR方法,从梅花基因组DNA和cDNA中分别克隆出CBF转录因子基因片段,克隆测序发现两种方法获得的基因序列相同,全
【机 构】
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北京林业大学园林学院,国家花卉工程技术研究中心,北京100083
【出 处】
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中国园艺学会观赏园艺专业委员会2012年学术年会
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根据Genbank已发表的ERF基因序列设计特异性引物,采用PCR和RT-PCR方法,从梅花基因组DNA和cDNA中分别克隆出CBF转录因子基因片段,克隆测序发现两种方法获得的基因序列相同,全长816bp,可编码271个氨基酸.在此基础上运用生物信息学方法对该序列进行结构及功能的分析,通过Blast、CDD、ORF Finder、DNAMAN、MEGA4.1等数据库和软件分别分析该基因的ORF区域、生物保守域及推导的氨基酸序列.结果表明所得基因序列具有典型的ERF基因的结构特点,包含AP2/EREBP功能域,此外氨基酸同源性分析也表明克隆的得到的序列和其他物种的ERF基因同源性较高,进一步进化分析表明其与毛果杨的亲缘关系较近,由此说明成功克隆了梅花ERF基因,这将为后续的下游分析及分子育种奠定基础.
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