H7N2禽流感病毒分离株研究:Ⅳ.禽流感病毒CK/HB/1/02神经氨酸酶全基因序列分析

来源 :中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届全国会员代表大会暨第11次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaolan
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为了进一步验证禽流感(AIV)分离毒株的神经氨酸酶(NA)亚型,比较其NA基因与已知AIV的NA基因的同源性,分析其NA基因的遗传演化背景,本文对AIV分离株CK/HB/1/02的NA全基因序列进行了分析.采用针对AIVNA基因的引物,经RT-PCR扩增出一条约1.5Kb的DNA片段,测定其核苷酸序列并与GenBank中AIVHA基因序列进行了同源性比较和氨基酸编码分析,并绘制了NA基因的系统发育进化树分析.结果表明,本研究测得了AIV分离株NA基因的完整序列,长度为1467bp,包括5-末端和3-末端的非编码区,其最大阅读框(ORF)编码469个氨基酸,包括23个氨基酸组成的信号肽和446个氨基酸组成的NA蛋白.该病毒NA基因的核苷酸序列与GenBank中人类流感病毒A/Leningrad/134/57(H2N2)的NA基因同源性最高,为93.7﹪;其次为香港的鸭源、人源、猪源H3N2病毒(约为89﹪~93﹪);而与广东、北京、香港、韩国的H9N2AIV以及美国的H7N2AIV的同源性较低(约为87﹪~88﹪).在N2基因系统发育进化树中,分离株CK/HB/1/02处于欧亚分支内,与人流感H2N2亲缘关系较近;与已经报道的北美H7N2AIV处在不同分支,遗传距离较远.
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