【摘 要】
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将七鳃鳗miRNA前体(pre-miRNA)序列的结构特征作为支持向量机工具Lib-SVM的输入向量,经Grid程序优化参数后,开发出一个七鳃鳗pre-miRNA序列预测程序Lj-miRSVM,通过10倍交
【出 处】
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中国计算机学会多值逻辑与模糊逻辑专业委员会第十四届学术会议
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将七鳃鳗miRNA前体(pre-miRNA)序列的结构特征作为支持向量机工具Lib-SVM的输入向量,经Grid程序优化参数后,开发出一个七鳃鳗pre-miRNA序列预测程序Lj-miRSVM,通过10倍交叉验证法,算出平均敏感性和特异性分别为95％和95.9％,准确率为95.8％,ROC曲线下的面积比约为98.9％.研究表明实验中提出的结构特征提取方法和Lj-miRSVM预测程序可以有效地预测七鳃鳗pre-miRNA.此外,用Lj-miRSVM预测程序对其他20个物种的pre-miRNA进行预测,平均正确率为78.5％.实验结果表明,Lj-miRSVM预测程序具有较好的推广性.
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