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中国特有小型猪有望为异种移植提供安全可靠的合适供体。猪内源性反转录病毒是异种移植中最受关注的病毒。然而，目前对中国特有小型猪来源的猪内源性反转录病毒的研究尚不深入。本研究中，应用PcR技术将五指山猪内源性反转录病毒前病毒全基因分为两段进行扩增，然后构建前病毒全基因克隆，运用生物信息学方法对其序列进行分析，并与Genbank中收录的其他PERV全基因序列进行比对，在此基础上还进行了进化分析，构建了基于Env氨基酸序列的进化树。结果表明，五指山猪来源的PERV前病毒全长为8899bp，含有完整的gag、pol、env的0RF，两端为5’LTR与3’LTR两个长末端重复序列。序列比对分析发现PERV—wzsP与其他来源的PERV毒株高度相似但仍具有一定的差异性。进化分析结果表明PERV—wzs与其他A亚型毒株属于同一分支，这与PCR分型鉴定的结果也相一致。此外，我们还发现该株PERV前病毒的5’LTR中有多个u3重复金的存在，这可能会导致PERV—wzs在宿主细胞中复制能力的增强；3’LTR中含有PERV—c亚型中的特异性序列，这将可能导致部分的PERV—c序列与PERV—A序列发生重组。然而，我们还需要进行更深入的研究来对这种推测进行验证。本研究有助于深入了解五指山猪内源性反转录病毒的分子生物学特性，并为下一步构建PERV感染性克隆奠定了良好基础。