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研究目的：Hebert于2003年提出一种可用于分类鉴定和研究系统发生关系的分子工具——DNA条形码.之后,这种新兴的技术成为了分类学领域的一个研究热点.目前,在DNA条形码研究中,较广泛地使用距离法(基于种内和种问不同个体间的基因的差异程度)和系统树法(要求同属于一个种的所有个体在系统发生树上聚为一个单系的分支).近年来,许多文章指出这两种方法存在很多的弊端,不适用于物种的鉴定.一种新的条形码方法——特征法,作为这两种方法的替代和补充被提出、应用.该方法的原理是同一个物种的个体具有共同的特征,而该特征不会存在于其姐妹群中.该研究通过多种分子标记,比较三种DNA条形码方法鉴定中国沿海樱蛤科贝类的适用性.方法和过程：本研究扩增了中国沿海樱蛤总科17个代表性形态种的93个个体的COI和16SrDNA基因片段.对所得的基因片段进行人工校正,最后选取的COI长度为650bp,16S rDNA的长度为500bp.通过MEGA5计算得到不同个体间的种内和种间遗传距离；基于K2P模型分别建立了NJ系统发生树；通过P-Gnome找到种内和种间的特征性碱基位点.结论：通过研究发现,该科不存在条形码间隙,种内遗传距离和种间遗传距离存在着重叠.15％-25％的物种不能被"10×法则"所区别.在种的水平上,系统树法和特征法表现的要比距离法好,他们能成功地鉴定出15个种.但是在属以及更高的分类单元,特征法比其他方法有效的多.另外,通过研究发现,存在争议的缢蛏属,在分子学上与刀蛏的亲缘关系要比其与总角截蛏的亲缘关系近的多,所以应该将其作为一个属或者亚属划分到竹蛏总科的刀蛏科.该论文成功地展示了DNA条形码的不同方法在鉴定樱蛤科物种的有效性,尤其是特征法.但是,综合方法在分类学和系统发生学种更重要而且是必不可少的.