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塔里盆地西南坳陷的构造发育制约了含油气系统的形成与演化。塔西南坳陷具有三期被动陆缘（或坳陷）层序与三期前陆盆地相叠加的地质结构，以古生代塔西南隆起、新生代麦盖提转化型斜坡与巴楚反转型前缘断隆为主要特征。阿瓦提南－－巴楚寒武、奥陶系含油气系统以克拉通局限台地内坳陷沉积为烃源岩，石炭系、下二叠统含油气系统以被动陆缘层序沉积为烃源岩，烃源岩厚度大、分布广、质量好；侏罗系含油气系统局限于山前，以近海断陷湖盆沉积为烃源岩，烃源岩丰度高、类型好、厚度大，含油气系统形成晚。这三个含油气系统具有分区发育特征，部分具交叉或重叠关系。以含油气系统为勘探单元，可制定相应的勘探战略，从而加快该区油气勘探的步伐。