中国小麦花叶病毒RT-LAMP检测体系的初步建立

来源 :中国植物病理学会2011年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhelehang
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中国小麦花叶病毒(CWMV)是Vigaviridae真菌传棒状病毒属成员,经介体禾谷多黏菌传播。目前环介导的恒温扩增(LAMP)已被应用到马铃薯、番茄、小麦、水稻、桃等多种作物上发生的植物病毒和类病毒的检测。本研究应用在线软件Primer Explorer V4针对CWMV RNA2的ORF3设计了3套LAMP引物。小麦叶片液氮冷冻后研碎,通过水酚抽提LiCI沉淀的方法提取总RNA。一步法RT-LAMP的反应体系参考大麦黄矮病毒的RT-LAMP检测体系并略作调整,使用M-MLV作为反转录酶。扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。首先,在设计的3套引物中只有第1套可以使CWMV病叶RNA扩增出阶梯形状条带,使用其余2套引物扩增时病样与健康样品均无LAMP特征条带出现,说明第1套引物扩增效果较为理想,而其余2套在引物设计中可能存在问题,或者反应条件仍需进一步优化,以后实验均采用第1套引物。随后,以健康叶片RNA、WYMV病叶RNA、CWMV病叶RNA为模板进行RT-LAMP,结果作为对照的健康样品及WYMV病样均不能被扩增产生LAMP特征条带,而CWMV病叶扩增结果正常,说明该引物能够特异地检测CWMV。为了进一步验证RT-LAMP检测的灵敏度,以经10-1~10-6梯度稀释的CWMV病叶RNA为模板进行RT-LAMP,同时以针对于RNA2 0RF3的常规RT-PCR检测作为对照,结果模板经104倍稀释后仍可出现RT-LAMP阶梯条带,而常规RT-PCR的检测极限仅为10-2倍,说明RT-LAMP比常规RT-PCR更为灵敏,这与其他文献报道结果相似。最后,对来自山东、河南、江苏、湖北等地的11份田间样品进行了CWMV RT-LAMP与RT-PCR检测,样品当中只有山东烟台的样品为CWMV阳性,其余均为阴性,RT-LAMP与常规RT-PCR检测结果一致,说明该检测方法切实可行,不需要专门的PCR扩增仪器,可以应用于田间检测。
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