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“肺与大肠相表里”理论是中医脏腑表里学说的重要组成部分之一。与现代医学相比较，这种从脏腑之间相互作用、相互影响的角度出发，从整体水平认识疾病，解释人体生理、病理及其联系的观点，凸现了传统中医理论诊治疾病的优点，本文应用蛋白质组学技术，通过制造小鼠“久咳’、“便秘”证候模型，观察小鼠肺组织、肠道裁膜组织的蛋白变化，筛选候选蛋白，发现肺与大肠的生理及病理上相关性蛋白，从而找到“肺与大肠相表里”藏象理论的现代医学基础，揭示“肺与大肠相表里”藏象理论的实质。