【摘 要】
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RNA-Seq技术作为一种新的转录组研究方法,能够更为快速、便捷、准确地提供更多的生物体转录信息,为研究棉花纤维伸长相关基因搭建了强有力的技术平台.本研究以陆地棉K312
【机 构】
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中国农业科学院生物技术研究所,北京100081
【出 处】
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全国农业生物化学与分子生物学第十四届学术研讨会
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RNA-Seq技术作为一种新的转录组研究方法,能够更为快速、便捷、准确地提供更多的生物体转录信息,为研究棉花纤维伸长相关基因搭建了强有力的技术平台.本研究以陆地棉K312为材料,提取叶片和纤维混合样品的RNA,利用Illumina HiSeqTM2000进行转录组测序,共获得63,396,775 clean reads.通过Trinity软件进行拼接,共获得了长度大于200 bp的转录本210205个,总长度约为279 Mb,平均长度为1329 bp；拼接出71,295 unigenes,平均长度为649bp.
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