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垦丁国家公园海岸以美丽的珊瑚礁生态为主要观光资源，然而由于自然环境因子之影响(包括台风、气候变迁、涌升冷水入侵、二氧化碳浓度变动)，已使得许多珊瑚礁生态面临极大的威胁。海水温度对于珊瑚礁生态，以至于珊瑚的生长、生殖、生理与白化现象等扮演重要关键因子；垦丁海域曾经遭受到核能电厂温排水之影响使得珊瑚白化，并对各种海洋生物群聚造成相当程度之影响；影响垦丁海域海水温度变动的因素主要有黑潮及其支流、南海表层流、南湾海域涌升流及台风引起的深层冷水团上升，这些因子对垦丁珊瑚礁生态系统之影响如何？值得 深入研究探讨。南湾海域因为自然之因素对海洋生态造成各种影响，因而发生海洋生态意外事件亦屡见不鲜，例如 1988 年11 月发生之南湾鱼群冻毙事件及2008 年7 月南湾海域鱼体大量死亡事件。本研究利用”南湾海域水质环境资料即时连续监测计画”之执行，进行一连串有关珊瑚礁生态受到冷水入侵影响之研究，在此珊瑚礁环境观测网计画之监测项目包括：温度、盐度、导电度、溶氧、酸碱值及浊度；此外，本研究亦针对受到温度波动之珊瑚生理反应进行测试。由于本资料之长期性及连续性，有效解析环境水体中各种因子对珊瑚礁生态系短周期性与珊瑚礁生态长期变化之影响情况，当海洋意外事件发生时，本研究数据亦可提供做为第一时间关键性之资料解读。