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马铃薯Y病毒(Potato Virus Y,PVY)是生产上严重影响马铃薯、番茄、烟草等多种作物产量和品质的病毒之一,每年造成极大的经济损失.为了进一步揭示PVY与寄主互作的分子机制,我们研究了烟草在PVY侵染后的miRNA和mRNA的变化.结果 表明,来自29个家族的83个miRNA表达发生了变化,在mRNA水平,有8133个基因表达发生了变化.GO分类研究表明变化的基因主要富集在DNA/RNA结合蛋白、催化活性以及信号转导分子.通过对miRNA和mRNA两组数据的整合分析,共有88个miRNA和mRNA组合对被鉴定出来.我们还发现了PVY病毒来源的小RNA(vsiRNA)能够靶向烟草的翻译肿瘤控制蛋白(NtTCTP)并介导烟草对PVY的抗性.综合以上结果,我们的研究为揭示病毒与烟草的互作提供了新的研究视角.