嗜盐古菌CRISPR-Cas适应新病毒的机制研究

来源 :中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zsq789456
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
CRISPR-Cas是最近发现的一种原核生物免疫系统,广泛分布于细菌(40%)和古菌(90%)基因组中.目前研究表明该系统通过产生小分子CRISPRRNA(crRNA),指导Cas蛋白降解与之同源的外源核酸分子(如病毒和质粒),然而,获取外源DNA序列(适应)的具体机制尚不清楚.利用新构建的古菌-病毒互作模型,对古菌CRISPR系统适应新病毒的过程进行了深入研究.本实验室前期工作表明,极端嗜盐古菌富含CRISPR-Cas系统,且其crRNA的生物加工过程非常活跃。近期,从辽宁葫芦岛的环境样品中分离到了一株西班牙盐盒菌的新病毒HHPV-2,并建立了该病毒的纯化流程.结果发现,在HHPV-2侵染过程中,西班牙盐盒菌携带的CRISPR-Cas系统能成功获取病毒序列,并作为新的repeat-spacer单元插入到CRISPR结构中.通过分析大量新产生的spacer序列,鉴定了I-B亚型系统特有的PAM(pre-spaceradjacentmotif)序列(TTC),并发现了一种基因组位置依赖的链特异性,即对于部分病毒基因组区域,正链序列更容易被获取形成新的spacer,而对于另一部分区域,负链更容易被获取.这一特殊的链特异性暗示,除了PAM序列以外还有其它的因素影响pre-spacer的选择,其背后的机制有待于进一步的研究.另外发现,crRNA生物合成阶段和干扰阶段的关键Cas蛋白,对于高效的适应过程也是至关重要的.综上,通过研究古菌适应新病毒的过程发现了适应阶段的新的特征,这将有助于进一步了解这一未知机制。
其他文献
普通小麦的起源经历了两次异源多倍化过程,通过未减数配子结合引起的染色体加倍被认为是普通小麦起源的重要途径.前人研究发现一些四倍体小麦与山羊草、黑麦等近缘种的杂种F1
会议
氯丝菌素是S.antibioticus DSM 40725产生的一类螺环乙酰乙酸内酯类抗生素,有着抗感染、抗肿瘤和抑制胆固醇合成等生物活性.本课题主要研究氯丝菌素簇内调控基因chlF1(TetR家
会议
长期以来,抑制细菌分裂被认为是有潜力的抗菌靶标.FtsZ是主要的细菌细胞骨架蛋白,是调控细菌细胞分裂的主要物质,广泛存在于细菌和古菌中,且序列保守,具有GTP酶活性位点且和
会议
核糖核酸酶超基因家族(RNASE A)是进化生物学中研究新基因起源及新功能演变的重要模式系统之一.核糖核酸酶超基因家族中的很多成员表现出基因重复(生)-假基因化(灭)的进化模
会议
有过担任戛纳电影节评委会主席殊荣的克林特·伊斯特伍德今年已经67岁,可看上去他至少比实际年龄年轻十岁。两年前他和32岁的记者迪娜·鲁伊斯结为伉俪,他们的小女儿摩根是
从1954年的《情定何人》至今,肖恩·康纳利已在影视圈中摸爬滚打了近半个世纪,拍摄了六十余部各类影片,主演的有近三分之二,创造的票房价值达十数亿美元之巨。康纳利成功的
作者使家兔肺泡巨噬细胞在培养基中接触石棉、硫酸铍和氧化铍。加上糖酵解酶(glyc-olytic enzyme),磷酸己糖异构转化酶(phos-phohexose isomerase)测定了培养基,全细胞匀浆,
目的:探讨不同大小计算网格对肝癌容积旋转调强放疗(volumetric modulated arc therapy,VMAT)剂量学和放射生物学参数的影响.方法:基于Eclipse v13.6计划系统Acuros XB算法对
建立住房市场体系,是我国住房改革的重头戏,也是一项艰巨复杂的任务,要把原来的住房实物福利分配,改为让居民到市场上去买房、租住房,是一项涉及方方面面的、任务艰巨的改革
前噬菌体是细菌基因组中重要组分,在宿主菌的毒力和适应多种胁迫中发挥重要功能.关于分枝杆菌前噬菌体的信息还比较缺乏.本文发现了分枝杆菌中11个新的前噬菌体.这些信息有助