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学科建设是高等院校和科研机构的一项综合性、长远性的工作，是全面提高人才培养质量，提高学校学术水平和整体水平的根本和基础。在中国，不论是教育部本科专业目录体系还是研究生学位目录体系，医学信息学至今中仍处于尴尬徘徊的窘境，学科建设进程缓慢，与当前医药卫生信息化的发展极不协调。因此，尽快将其纳入科学学术体系，在基础理论研究、技术方法研究和应用领域研究三个方面生成系统的专门知识，加强医学信息学学科建设，培养具有从事医学信息工作的专门人才是当前中国医学信息学的一项重要任务。本文结合作者对医学信息学科的认识和学科建设实践，从医学信息学概念辨析、学科建设的必要性、学科建设发展现状和学科前景展望四个方面对当前我国医学信息学学科建设问题进行了初步探讨，希望能引起教育主管部门和学术界的关注和共鸣。