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将各批药材不同提取部分进行指纹图谱对比后发现，产自甘肃的当归药材除了甘南样品的SCS部分外，各提取部分指纹图谱相似度均在0.900以上，因此若是以其中一部分的指纹图谱来考察甘肃各地当归药材，则不能全面的反映当归药材的整体质量。产自青海玉树和云南鹤庆的样品各部分指纹图谱的相似度均小于0.900。这一结果提示，要全面控制当归药材及其制剂的质量，药品生产企业应该使用GAP种植基地生产的药材。