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近年来，随着“人类微生物组计划”、“肠道元基因组计划”等研究项目的开展，以及测序技术的飞速发展，肠道菌群与宿主健康的密切关系得到了广泛的认可。目前，肠道菌群已成为阐释多种疾病，特别是慢性病发生机理，以及多种膳食因子(益生菌、益生元、微量元素、多酚化合物等)影响宿主生理功能的新着眼点。本文通过综述肠道菌群与宿主肠道内某些矿物质及维生素等微量元素的代谢关系，以及微量元素和肠道菌群与某些疾病的发生发展之间的作用关系，为阐明微量元素和肠道菌群的交互作用对宿主健康的影响提供依据。