大豆根瘤内生菌全细胞可溶性蛋白SDS-PAGE电泳图谱分析

来源 :第二十次全国环境微生物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wwb316
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  以大豆根瘤内生细菌为试验材料,分别采用单次点样、重复点样、不同上样量对其进行全细胞可溶性蛋白SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶)电泳分析,根据标准蛋白各条带的相对迁移率估算待测蛋白亚基的分子量范围,结合16S rDNA测序结果来区分大豆根瘤内生菌是否为同种或不同菌株,以便于后续研究.结果 表明:(1)单次点样时,不同菌株之间蛋白条带有差异,说明彼此间亲缘关系不同.经16S rDNA测序分析,菌株44最相似属种为Bacillus horikoshii、菌株52最相似属种为Sinorhizobium fredii、菌株70最相似属种为Ochrobactrum intermedium、菌株72最相似属种为Bacillus tequilensis /subtilis、菌株161最相似属种为Acinetobacter calcoaceticus、菌株166最相似属种为Pseudomonas geniculate、菌株1 70最相似属种为Stenotrophomonas sp.、菌株254最相似属种为Enterobacter ludwigii.(2)重复点样时,菌株7与53的蛋白图谱相同.经16S rDNA测序分析,两者最相似属种均为Bacillus subtilis,且最相似菌株均为HRA69,说明两者属于同一种内生菌.菌株123与125蛋白图谱相近,经16S rDNA测序、比对,两者最相似属种均为Bacillus cereus.(3)电泳结果显示,对同一菌株不同上样量不影响蛋白图谱,16S rDNA测序结果表明同一菌株最相似属种始终不变,即不影响亲缘关系.由此可知,对筛选菌株进行全细胞可溶性蛋白SDS-PAGE电泳分析是研究大豆根瘤内生菌系统发育关系的有效辅助手段.
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