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根据GenBank中猪圆环病毒2型(PCV2)ORF2基因序列，设计一对引物，通过PCR方法从采自不同地区的七份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)的仔猪组织病料中分别扩增出PCV2的ORF2基因。将获得的ORF2基因片段分别克隆入pMD18-T载体，通过筛选获得重组质粒，分别命名为pMD—PCV2-HN01、pMD—PCV2-DY01、pMD—PCV2-HMO1、pMD-PCV2-SDqd01、pMD-PCV2-SDqd02、pMD-PCV2-SDqd03、pMD-PCV2-PD01，并进行测序及序列分析。结果表明：HN01株ORF2基因全长为705bp，另六株ORF2基因全长均为702bp。七株分离株的ORF2基因核苷酸序列同源性较高，为94.096～99.996，氨基酸序列同源性达93.6％以上。七株与GenBank中登录的德国株和台湾株的核苷酸序列同源性较低，分别为91.7％～93.2％和89.0％～90.5％，而与丹麦、法国、中国株的核菅酸序列同源性较高，达94.0％以上，氨基酸序列同源性均达89.3％以上。