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本文基于45头大白猪和45头通城猪的60K芯片分型数据，借助遗传分化系数Fst进行选择信号检测分析，旨为进行猪产肉、抗病等性状候选基因和致因突变深入挖掘提供有益参考。
大白猪和通城猪的全基因组选择性清扫分析
【摘 要】
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本文基于45头大白猪和45头通城猪的60K芯片分型数据，借助遗传分化系数Fst进行选择信号检测分析，旨为进行猪产肉、抗病等性状候选基因和致因突变深入挖掘提供有益参考。
【机 构】
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华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，农业部猪遗传育种重点开放实验室，湖北武汉，430070
【出 处】
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第十三次全国畜禽遗传标记研讨会
【发表日期】
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2012年3期
其他文献
本研究采用A1u1-RFLP、qRT-PCR等技术分析不同羽色鹌鹑群体MC1R基因突变的差异及MC1R基因在4种羽色鹌鹑个体中的相对表达量，以探寻MC1R基因表达量与羽色表型之间的相关性，为进一步研究鹌鹑羽色的突变和遗传机制提供依据。
为了进一步探索鹅SCD1基因表达的调控机制，从5’和3’调控区着手，进行其调控区的功能研究，继而深入了解该基因的功能以及其与产肝性能之间的关系。
本文对豁眼鹅的GH基因外显子2进行了PCR-SSCP检测，并对其多态性与体重和体尺性状进行了关联分析，为今后豁眼鹅的育种过程中的标记辅助选择(MAS)提供理论依据。
本研究以6个不同地方的中国地方猪种为材料，对猪EPAS1基因外显子12的序列变异情况进行了研究和分析。结果表明：H2, H6和H8三种单倍型相对频率较高，分别为34.4%, 19.4%和21.5%。
本研究选取了影响鹅羽毛和毛囊发育的两个主要功能基因BMP4和FGF5，采用实时荧光定量PCR方法分析这两种基因在鹅胚胎期和生后期的表达差异，旨在为进一步研究鹅羽毛生长发育的基因调控通路提供参考。材料方法胚胎期21-30胚龄(E21-30)每隔两天采集一次，每次采集3枚；生后期10-130日龄每隔10天采集鹅的背部皮肤样本3个，剥离鹅背部皮肤，迅速投入液氮中冻存，用于RNA的提取以及基因表达量研究。
本实验研究通城猪和大白猪GBPs基因的cDNA克隆，以分析两品种在GBPs基因序列和结构上的差异。建立合理的实验条件，用clustalx软件对猪中的GBPs各成员进行蛋白序列比对，分析其同源性。结果发现猪中GBPs家族与人和鼠一样，都存在主要保守区，且大白猪与通城猪之间存在一些序列差异。
本文检测了性成熟期苏钟猪全身组织内Ephrin B2基因的mRNA表达，并在长白猪、大白猪、杜洛克猪、二花脸猪、苏钟猪、梅山猪和金华猪井7个品种猪群中检测了Ephrin B2的SNPs进一步对基因多态性与猪产仔数进行了关联分析。
本研究以山西地方猪种马身猪和国外猪种大白猪为试验对象，研究不同猪种生肌调节因子myoD基因转录水平上的差异，从基因水平上对马身猪和大白猪生长速度及肉质品质的差异展开研究。
为探讨睾丸注射法制备转基因猪的高效性，本试验应用PCR检测、Southern印迹杂交、荧光定量PCR分析等技术，检测通过睾丸注射法制备的第一代转pGH基因猪阳性率。利用FISH杂交技术研究外源基因在染色体上的具体整合情况，对比外源基因在不同个体基因组中的整合位点与数目，为转基因动物的定向培育及研究杂交数目与日增重相互关系提供依据。
本研究利用含有荧光素酶报告基因的pGL3-Basic载体，可以利用其生物发光的特性定量地检测启动子的启动活性(Nguyen et al.,1988 )。分别将大蒲莲猪和商品猪的USP18基因的5’调控区2.48K片段连入pGL3-basic载体，经荧光素酶活性检测数据统计发现，大蒲莲猪usp18基因启动子活性明显高于商品猪，这与大蒲莲猪USP18 mRNA水平表达量高于商品猪的结果相符。