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丝状真菌基因表达调控研究多以构巢曲霉、黑曲霉、米曲霉等模式微生物为研究对象。研究蛋白质与DNA的相互作用，发现具有基因表达调控作用的蛋白质因子及其顺式作用元件对于深入开展丝状真菌的蛋白表达、分泌、次级代谢等基础生理研究，发掘丝状真菌次级代谢产物的经济价值(工业应用、药用等)，开发具有重要工业应用价值的重组蛋白表达系统等具有重要意义。本研究采用DNaseI footprinting技术，结合高通量DNA测序方法，分析丝状真菌基因组中的DNaseI保护位点，利用生物信息学分析算法聚类分析保护位点序列，获得保守的顺式作用元件序列，进而深入分析顺式元件对应的蛋白调控因子，在基因组全局水平上对丝状真菌的蛋白质-DNA相互作用进行研究，促进真核微生物蛋白表达调控的研究及其相关应用研究。