新疆不同地方斗鸡类群的遗传多样性分析

来源 :第十一次全国畜禽遗传标记研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:maming5201ww
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利用8个微卫星位点对吐鲁番、喀什和伊犁斗鸡进行了群体杂合度、多态信息含量、有效等位基因数等的遗传检测,分析了群体间的遗传距离和系统聚类.结果表明:3个地方斗鸡群体在8个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异,吐鲁番斗鸡的平均基因杂合度最高为0.8255;伊犁斗鸡的平均遗传杂合度最低为0.7874.平均多态信息含量也出现了类似的结果,说明吐鲁番斗鸡的遗传多样性最丰富.喀什斗鸡与伊犁斗鸡的遗传距离最远为0.3859;喀什斗鸡与吐鲁番斗鸡的遗传距离最近,为0.2051. 本文为新疆不同地方斗鸡的保种、选育、开发与利用提供科学的参考依据.
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利用鸡的dbSNP数据库,在鸡一号染色体(GGA1)Contig.060226.1上一个200Kb的区域筛选了36个SNP标记.通过多态性检验,最终选取了多态性丰富的21个位点在红色原鸡(Red Jungle Fowl,RJF)、丝羽乌骨鸡(Taihe silk Chicken,TS)、隐性白洛克鸡(White Recessive Rock,WRR)三个群体中进行基因型定型.以r2为统计量,估算了
垂体特异性转录因子1(PIT1)是调控催乳素、生长激素和促甲状腺激素B表达的重要转录因子,因此PIT1基因被认为是影响鸡经济性状的重要候选基因.本研究首先利用比较基因组方法,对鸡等20个动物种的PIT1基因进行进行了系统进化分析;并选取鸡PIT1基因的7个多态性位点(M1-M7),对隐性白洛克肉鸡等7个品种进行群体多样性研究。结果表明,PIT1的POU区域在不同动物种间表现出较高保守性,聚类分析显
利用多态性丰富的15个微卫星标记对10个列入国家保护名录的鹅品种的群体遗传结构、遗传分化及基因流进行研究,结果表明:10个鹅群体总近交系数(Fit)为-0.044,群体内近交系数(Fis)为-0.408,群体间基因分化系数(Fst)为0.257,3个指标只有Fst达到极显著水平(P<0.001).鹅群体内近交系数(Fis)均为负值.各个鹅群体间,豁眼鹅与伊犁鹅的基因流值最小(Nm=0.416),四
本文利用华南农业大学资源群杏花×隐性白洛克全同胞参考家系对鸡生长激素受体(growth hormone receptor CHR)基因5’侧翼区的3个SNP3位点与鸡生长.陛状的相关性进行了研究,结果表明:(1)G6542806A位点不同基因型对杏隐参考家系F2代公鸡的35、63日龄体重、42日龄体重、胫长和胫直径,49日龄体重和胫长、宰前活重、屠体重都表现出了显著性差异(P<0.05),并与公鸡
作者以前采用203对微卫星标记对缙云麻鸭资源群体F0代(30只白壳母鸭,10只青壳公鸭)进行多态性分析,结果发现微卫星标记AY493302中的一个纯合基因型(360bp左右)只在青壳的缙云麻鸭中出现,而在白壳的缙云麻鸭中尚未出现。本文拟扩大样本量,采用50只青壳缙云麻鸭及30只白壳缙云麻鸭的血液DNA对微卫星标记AY493302进行多态性分析,以期探索这个微卫星标记是否与缙云麻鸭的蛋壳颜色相关,为
通过对兴国灰鹅的血液生化指标与产蛋量及70日龄体重的相关性分析,确定血清碱性磷酸酶活性为兴国灰鹅产蛋量早期间接选择的遗传标记,血清白蛋白相时舍量为兴国灰鹅70日龄体重间接选择的遗传标记,并应用与兴国灰鹅的育种实践中,取得了较好的选择效果,使兴国灰鹅的产蛋量提高了100%,70日龄体重提高了6.8%,证明应用生化遗传标记进行兴国灰鹅的早期间接选择是可行有效的.
采用微卫星标记方法,对中国西部宁夏固原鸡、西藏藏鸡、陕西省的略阳鸡、太白鸡、陕北鸡和南方海南文昌鸡共6个品种,560个个体19个微卫星位点的遗传结构和品种间血缘关系进行了分析研究.结果表明中国地方品种均具有丰富的遗传变异,其中藏鸡具有极为丰富的遗传变异,杂合度达到0.8220.品种间存在极显著的遗传分化.固原鸡和文昌鸡的遗传距离较近,可聚为一类.藏鸡与这两个品种鸡均遗传距离较远,单独聚为一类;陕西
选择与番鸭屠宰性能QTL连锁的8个微卫星基因座,对160只白羽番鸭的屠宰性状进行群体遗传学检测;并进行微卫星标记与屠宰性能的关联分析.结果表明,不同基因型各屠宰指标的最小二乘均数以位点CAUD035和位点CAUD076差异性最显著(P<0.05),可作为番鸭屠宰性状选择参数.
基因组密码子使用受多种因素的影响,本试验通过对应分析探讨了若干重要因子对鸡线粒体基因组序列密码子用法的效应。结果指出,在影响最大的第一条向量轴上,基因的位置坐标与该基因的GC3s和GC含量显著相关:r=0.582(p<0.05)和r=0.922(p<0.01);而G+C含量与CAI的相关系数r=-0.823(p<0.01),表明高表达的基因偏爱含A或T的密码子。
以杏花鸡、清远麻鸡、丝羽乌骨鸡、藏鸡、海东鸡、大骨鸡、太白鸡、红色原鸡为研究对象,利用克隆测序方法分析了Hsp70基因的多态性。研究表明:Hsp70基因的5’、3’UTR及编码区共发现11个SNPs和2个缺失突变。在8个品种中发现的多态性都不在调控区,SNP没有引起Hsp70氨基酸的改变,表明编码区的氨基酸高度保守。