【摘 要】
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基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是分析全基因组表达模式的有力工具。SAGE数据具有维数高、数量大等特点,在模式识别和聚类分析前需降维。根据SAGE
【机 构】
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大连海事大学信息科学技术学院,大连,116026
【出 处】
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中国电子学会电路与系统学会第二十二届年会
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基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是分析全基因组表达模式的有力工具。SAGE数据具有维数高、数量大等特点,在模式识别和聚类分析前需降维。根据SAGE数据满足Poisson分布的特性,设计了新的核函数,结合核主分量分析(KernelPrinciple Component Analysis,KPCA),本文提出了基于Poisson模型的KPCA算法(Poisson-Model basedKPCA,PMKPCA)。通过对老鼠视网膜细胞发育的SAGE数据的分析,结果表明,该算法相对于KPCA,能有效的去除冗余数据,降低维数。
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