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[目的]用形态学与线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(mitochondrion DNA cytochrome c oxidase subunit Ⅰ,mtDNA-CO Ⅰ)分子鉴定方法分析我国部分地区蚊虫种类,为设计并开发蚊虫形态与分子鉴定系统提供科学依据.[方法]参考国内陆宝麟的《中国动物志昆虫纲第8、9卷蚊科》和《中国重要医学昆虫分类与鉴定》,并结合生命条形码数据系统(Barcode Of Life Database,BOLD)与沃尔特·里德生物系统单元(Walter Reed Biosystematics Unit,WRBU)对蚊虫进行形态鉴定.单只蚊虫提取基因组DNA,参考国际双翅目通用引物扩增蚊虫COⅠ 5端基因,连接pMD18-T载体并转化DH5α感受态细胞克隆CO Ⅰ基因,抽提阳性克隆质粒并进行单、双酶切鉴定后送公司测序.用MEGA5.05、DNAMAN8.0、Clustal1.83等软件包对序列进行修正、比对和特征分析,蚊虫聚类关系采用K2P和p距离法,系统发育树构建采用最大简约法、最大似然法和邻接法.[结果]共获我国12省28地区的蚊虫,形态学鉴定获9属(亚属)23种(亚种),蚊虫的COⅠ片段为651bp,保守位点413个,变异位点238个,简约信息位点196个,A+T含量为68.8％,全组数据中颠换值高于转换值,碱基替换表现明显差异.COⅠ基因编码217个氨基酸残基,包含18种氨基酸,其中使用频率最高的为亮氨酸(Leucine,Leu).不同蚊种间的COⅠ片段碱基变异颠换数高于转换数,核苷酸序列同源性为93.38％-99.95％,其编码的氨基酸序列同源性为97.97％-100％.COⅠ核苷酸序列及其编码的氨基酸序列的系统进化关系均显示：蚊虫的分子鉴定结果与其形态鉴定结果吻合；尽管来自不同地区,同种蚊虫均聚为一簇.[结论]形态学与COⅠ分子标记鉴定方法的结合,能准确有效地鉴定我国部分地区蚊虫的种属,为进一步设计开发蚊虫鉴定数据库奠定基础.