三株新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析

• 作 者: 袁萍[1]闫丽辉[2]成进[3]汪萍[3]柏庆[1]李延涛[1]
• 机 构: 新疆天康畜牧生物技术股份有限公司,乌鲁木齐 830011
• 出 处: 中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十三次学术研讨会
• 发表日期: 2009年期

本试验利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)分别扩增出新城疫病毒(NDV)青海株(QH3)、黑龙江株(HLJ)和甘肃株(A4)的融合蛋白基因的全长核苷酸，再克隆到pMD18-T载体中。经酶切和质粒PCR鉴定，获得阳性重组质粒后，进行序列测定并推导出其氨基酸序列，同时进行了分析和比较。序列分析结果表明，所获得的3株分离株F基因完整的开放阅读框长度为1662bp，共编码F蛋白的553个氨基酸;3个毒株之间的核苷酸序列同源性为88.0％～90.6％;与常用疫苗株之间核苷酸序列同源性只有85.3％～91.6％。三者F基因的裂解位点均为112R-R-Q-K/R-R-F117，符合强毒株裂解区氨基酸组成的特征。以1～374bp的核苷酸序列绘制系统发育树分析表明：QH3株NDV为基因Ⅷ型;A4株NDV为基因Ⅵ型;HLI株NDV为基因Ⅸ型。