全基因组背景下易变山羊草中内参基因的筛选

来源 :2015中国遗传学会大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wf3281124
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  传统的Actin,Tubulin等常作为内参基因被广泛应用,他是构成细胞骨架的主要成分,具有基因高度保守、mRNA表达数量高且稳定等特点。但是在易变山羊草受到线虫胁迫的不同时期进行研究发现,细胞组成型表达的基因在线虫取食位点建立过程中,基因的表达量变化上下浮动变化较大,已不适合用作内参基因。通过转录组分析结果发现,在生物胁迫和非生物胁迫条件下筛选适合易变山羊草转录水平研究的内参基因时,Actin,Tubulin等常用基因也是是表达最不稳定的基因。并且Actin等的表达量稳定性也容易受假基因的存在而干扰。从前述研究可以看到,不同品种在给定的实验条件下,利RT-qPCR准确量化的基因的表达必须有表达相对稳定的基因作为内参。
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