【摘 要】
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矿山酸性废水(acid mine drainage,AMD)是微生物生态与进化研究的重要模式系统。我们的大规模环境采样及16S rRNA高通量测序分析,发现大尺度的AMD微生物多样性格局主要由
【机 构】
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中山大学生命科学学院,广州510275
【出 处】
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中国生态学学会微生物生态专业委员会2016年学术年会
论文部分内容阅读
矿山酸性废水(acid mine drainage,AMD)是微生物生态与进化研究的重要模式系统。我们的大规模环境采样及16S rRNA高通量测序分析,发现大尺度的AMD微生物多样性格局主要由现代环境变化决定,而地理隔离的相对贡献较小。比较宏基因组和宏转录组分析,揭示不同酸化阶段涉及不同的、与变化的地球化学条件相作用的微生物类群,而AMD微生物的基因转录谱与原地的物理化学特性密切相关。应用一种分而治之的新策略,同时整合宏转录组拼接数据,成功获得AMD群落中未培养和/或稀有物种的draft基因组,揭示这些未知、但潜在重要的微生物种群的生态角色。利用基于人工神经网络的先进模型方法,成功预测了不同地理隔离AMD群落中微生物的分类组成和功能动态。以上成果显著拓展对极端酸性环境生命形式与过程的了解。
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