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目的：探索畲族有龋及无龋儿童的菌群结构和变化。材料及方法：对符合WHO取样标准的33名畲族无龋儿童和33名畲族有龋儿童的菌斑进行取样，利用454高通量焦磷酸测序方法，设计通用引物测序进行测序分析，分析畲族有龋及无龋儿童菌群结构多样性。结果：测序后总计得到372765条序列，经鉴定细菌来源14个门的68个属。健康儿童的菌斑多样性较高，且有龋无龋儿童的菌群结构有较大的差异。其中奈瑟氏菌属，链球菌，韦荣氏菌和放线菌在龋病儿童中的含量明显增高。结论：本实验全面分析了畲族儿童的口腔菌群结构，并且发现龋病的发生不是一种或两种特异致龋菌引起的，而是多种细菌共同作用的结果，支持生态菌斑学说。