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目的 戈登菌与分枝杆菌同属于抗酸染色阳性菌,且能够引起疑似结核病的肺部感染,在临床容易被误诊为结核病,对大多数抗结核药天然耐药,通过支气管戈登菌临床株的mmpL3(Rv0206c)同源基因进行序列分析,并对其蛋白质进行结构及功能预测,为后期的抗酸染色阳性菌诊断,药物靶标的筛选提供理论基础. 方法 根据全基因组测序结果和同源比对找到支气管戈登菌的mmpL3同源基因,应用expasy工具预测支气管戈登菌MmpL3同源蛋白理化性质；使用PSORTb分析蛋白质的亚细胞定位；蛋白质信号肽预测采用SignalP在线软件进行预测；利用Interproscan和Gene ontology工具对蛋白保守序列和功能进行预测；使用TMHMM在线工具进行拓扑结构预测. 结果 利用Blastp同源搜索找出MmpL3同源蛋白(Gbro4481),ProtParam分析得知,Gbro4481蛋白的氨基酸个数为1095,分子量为116.0512 kDa,理论与等电点为8.94,理论分子是为C5159H8270N1450Oi 522S34,PSORTb version 3.0预测其在细胞质膜表达,SignalP预测发现Gbro4481不存在信号肽切割位点,未发现信号肽存在,并预测其有10个跨膜区,N端和C端都在在胞外；MmpL3有两个保守结构域和一个固醇敏感多肽区；二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主.结合亚细胞定位、GO和结构分析显示其是一个细胞质膜上的膜蛋白. 结论 支气管戈登菌的Gbro4481为H37Rv的MmpL3同源蛋白,推测Gbro4481的功能同MmpL3相似,是分枝菌酸的转运蛋白,参与胞内小分子的运输和信号转导.